不當然違法。但是獨家協議可能會導致市場支配地位的認定的結果會發生變化。
比如,最典型的情況就是在原料制造企業跟經銷商簽了一個獨家經銷協議,通常會導致經銷商獲得在原料藥銷售市場上的市場支配地位,如果原料藥制造企業,因為牌照或者是其他的生產許可的原因是這個原料藥市場上唯一的或非常少的幾個供應商之一,則比較容易被認為具有市場支配地位的。如果沒有獨家經銷的一個模式,它就是原料藥經銷市場上的經營者,和經銷商之間、轉售商之間是在同一經銷市場上競爭的,通過簽署獨家協議,它實際上是把原料藥銷售市場的市場支配地位讓渡給了這個經銷商。
《原料藥反壟斷指南》也明確地給出了這樣的概念:對於藥品行業而言,制造和分銷的環節,是可以單獨去界定相關市場的。